Конституционность нового порядка избрания глав регионов, то есть механизма представления их кандидатур самим президентом, подтверждена Конституционным судом. КС РФ указал, что право президента представлять кандидатуру на должность главы субъекта РФ "не может рассматриваться как нарушение принципа разделения властей и принципа федерализма". Как подчеркивается в постановлении КС, право президента представлять кандидатуру высшего должностного лица субъекта РФ также не может рассматриваться как нарушение организации исполнительных органов госвласти РФ, необходимого баланса полномочий и законных интересов РФ и ее субъектов, а также не нарушает закрепленного в Конституции права граждан участвовать в управлении делами государства, избирать и быть избранным.
Таким образом, по мнению КС, оспариваемые нормы, утверждающие новый порядок наделения полномочиями глав субъектов РФ, не противоречат основному закону. КС РФ также отметил, что в целях более полного обеспечения прав субъектов РФ самим формировать свои органы исполнительной власти законодательство не исключает возможности представления президентом нескольких кандидатур, как и возможности внесения законодательным органом субъекта РФ предложений президенту по кандидатуре главы исполнительной власти региона.
По окончании оглашения постановления председатель КС РФ Валерий Зорькин сообщил журналистам, что у судей Конституционного суда не было единого мнения по рассмотренному вопросу. "У двух судей было особое мнение", - пояснил он. В пресс-службе КС РФ "Интерфаксу" заявили, что с особым мнением выступили судьи Анатолий Кононов и Владимир Ярославцев.
Кононов в беседе с журналистами сослался на высказывание немецкого юриста Отто Люхтерханда. "Здесь настолько ясно, что все неконституционно, и это ясно даже не юристу, что особых аргументов выдвигать не нужно", - сказал он, отметив, что присоединяется к этому мнению. По его словам, "никак не укладывается в Конституцию" тот факт, что у граждан отобрали права, которые уже были даны ранее. Главным нарушением, которое допускает закон "Об общих принципах организации законодательных (представительных) и исполнительных органов государственной власти субъектов РФ", утверждающий новый порядок назначения губернаторов, по его мнению, является "нарушение избирательных прав граждан". Он также считает неверным решение КС РФ, который не стал рассматривать жалобу СПС, просившего проверить конституционность норм данного закона, наделяющих президента полномочиями увольнять губернаторов за утрату доверия и распускать законодательное собрание региона при отказе утвердить внесенную президентом кандидатуру главы субъекта РФ.
В свою очередь один из заявителей жалобы в КС Владимир Гришкевич заявил журналистам, что, по его мнению, на суд оказывалось давление. "Прямое давление со стороны исполнительной власти на суд было накануне, когда в Государственной думе демонстративно был рассмотрен вопрос о переезде Конституционного суда", - сказал Гришкевич. По его мнению, КС не обратил внимания на статью, согласно которой "не подлежат умалению права граждан вне зависимости от их источника, а не только те, которые прописаны в Конституции ... По существу, принятое решение является неправовым".