Геном неуловимого ночного попугая

Австралийские исследователи впервые секвенировали геном ночного попугая (Pezoporus occidentalis), одной из самых редких птиц в мире, которую мало кому удавалось увидеть.

Ночной попугай был впервые описан английским орнитологом Джоном Гулдом в 1861 году. В XIX веке он был довольно широко распространен в Австралии, но сейчас он крайне редок. Предполагается, что его численность сократилась из-за изменений окружающей среды, таких как хищничество со стороны кошек и лисиц.

С 1912 по 1979 год представителей этого вида никто не встречал. В 1979 году группа ученых из Музея Южной Австралии наблюдала скопление птиц на севере штата. В 1990 году попугая видели в Квинсленде. В 2005 году трех птиц видели в Западной Австралии. В 2006 году мертвую самку нашли в национальном парке Диамантина в Квинсленде. В августе 2015 года, после полутора лет поисков, на юго-западе Квинсленда была поймана живьем, помечена и отпущена одна особь этого вида. В 2016 году в заповеднике Пуллен-Пуллен в Западном Квинсленде сфотографировали одного попугая. В январе 2017 крик птицы слышали на Северной территории. В марте того же года фотография живого экземпляра была сделана в Западной Австралии. В феврале 2018 снова удалось сфотографировать ночного попугая в заповеднике Пуллен-Пуллен. В ноябре того же года еще одну фотографию сделали коренные австралийцы в Большой песчаной пустыне в регионе Кимберли в Западной Австралии. В августе 2020 года представители народа марту и сотрудники Университета Квинсленда записали звуки ночных попугаев в пустыне Пилбара (Западная Австралия). Наконц, еще одна фотография была сделана в отдаленном регионе Западной Австралии в 2021 году. Это полный список подтвержденных наблюдений ночного попугая за последние 111 лет.

«Геном позволит нам изучить генетическую основу того, почему этот попугай ведет ночной образ жизни, что очень необычно для попугаев, — говорит Лео Джозеф, директор Австралийской национальной коллекции дикой природы CSIRO. — Мы будем исследовать такие способности, как навигация, обоняние, форма клюва и ночное зрение. Исследователи также смогут провести статистический анализ генома, чтобы оценить прошлые размеры популяций ночных попугаев в Австралии. Теперь у нас есть возможность сравнить этот аннотированный геном с другими близкородственными попугаями, проливая свет на причины его редкости и ограниченного распространения по сравнению со многими его родственниками».

Лео Джозеф и его коллеги секвенировали геном ночного попугая, используя образец, найденный в регионе Пилбара. «Доступ к высокопроизводительной технологии секвенирования в рамках Инициативы прикладной геномики CSIRO ускоряет исследования в области геномики в Австралии, — говорит Гунджун Панди из CSIRO Environment, руководитель проекта геномики ночных попугаев. — Теперь мы можем генерировать геномы очень высокого качества из очень маленьких образцов тканей — даже таких маленьких, как голова муравья или один комар. Такой уровень качества и детализации был просто невозможен даже пять лет назад. Генетические данные могут быть использованы для обеспечения максимального разнообразия программ сохранения, чтобы вид был устойчивым и имел наилучшие шансы на долгосрочное выживание».