В феврале 1996 года Генпрокуратура возбудила дело против губернатора Вологодской области Николая Подгорнова по обвинению во взяточничестве и превышении полномочий; одним из эпизодов обвинения стала взятка в виде строительства загородного дома. В декабре 1998 года он был признан виновным, приговорен к году условно и амнистирован, однако в мае 1999 года Верховный суд направил дело на пересмотр. 28 октября 1999 года Николай Подгорнов получил семь лет с частичной конфискацией имущества, но 15 июня 2000 года он был амнистирован.

В октябре 2000 года возбуждено дело против смоленского губернатора Александра Прохорова. Ему предъявили обвинение в нецелевом использовании госсредств на сумму 274 млн руб., выделенных на реконструкцию трассы Вязьма—Дорогобуж—Кардымово—Смоленск. 22 сентября 2004 года суд приговорил его к трем годам, но сразу же амнистировал.

В январе 2002 года прокуратура обвинила главу Ненецкого АО Владимира Бутова в злоупотреблении служебным положением при закупках топлива для региона, 10 апреля 2002 года — в неисполнении решения суда. В декабре оба дела были закрыты по «реабилитирующим обстоятельствам». 22 августа 2003 года против него возбудили дело за избиение инспектора ГИБДД. В декабре 2004 года он был приговорен к трем годам условно.

В сентябре 2003 года прокуратура обвинила тверского губернатора Владимира Платова в превышении полномочий и нанесении бюджету ущерба в 463 млн руб. По данным следствия, в 2002 году он инициировал эмиссию облигаций на заведомо невыгодных для региона условиях. 11 ноября 2005 года суд приговорил его к пяти годам колонии общего режима. 27 апреля 2006 года Мосгорсуд снизил наказание до трех лет условно.

В апреле 2007 года Генпрокуратура завела на губернатора Амурской области Леонида Короткова дело о превышении должностных полномочий. По версии следствия, он финансировал ФК «Амур» за счет завышенного энерготарифа, приобретал дорожную технику по завышенным ценам и незаконно выделял бюджетные средства на приобретение акций прииска Дамбуки. 10 мая президент РФ отправил его в отставку «в связи с утратой доверия». 27 декабря 2010 года суд оправдал экс-губернатора.

Как приговаривали губернаторов