Американская FDA на выходных одобрила к применению вакцину Pfizer, в понедельник, 14 декабря, вакцинация стартовала в США, во вторник — во всей России. Это означает, что в борьбе с коронавирусом наступил самый опасный этап: в ходе частичной вакцинации механизмы эволюции начинают работать на выживание вируса, а значит, на снижение эффективности вакцин.
В понедельник минздрав Великобритании сообщил, что включает Лондон в зону максимальных коронавирусных ограничений. Одной из причин названо распространение на юге страны нового, предположительно более заразного варианта коронавируса.
Но и коронавирус, который сейчас существует в мире, — тоже не совсем тот вирус, что впервые зафиксировали в Китае. Нагляднее всего это объясняет спецпроект агентства Reuters, напрямую изучившего 185 с лишним тысяч геномных последовательностей. Штамм L, выделенный в Ухане в начале года, перестал циркулировать в популяции к началу лета, но дал три последовательных мутации, одна из которых стала прародителем нынешних четырех доминирующих в мире штаммов G-типа.
G-тип несет в себе мутацию шиповидного белка D614G, которая позволяет этому типу вируса эффективнее проникать в клетку, из-за чего может обладать большей заразностью. Он полностью вытеснил все прочие варианты уже к началу осени.
То, что вирус мутирует и будет это делать в будущем, — абсолютный факт, пишет BBC. Задаваться нужно другим вопросом — изменилось ли его поведение из-за мутаций, и пока ответ на него скорее отрицательный.
Несмотря на заметную скорость мутаций коронавируса (примерно две на геном в месяц), подавляющее большинство их нейтральны (в полном соответствии с современной теорией эволюции) и даже не сказываются на синтезе белков — то есть никак не влияют на естественный отбор. В геноме «британского» варианта коронавируса предположительно десятки мутаций, но только две замены — N501 на «верхушке» шиповидного белка, первой связывающейся с клеткой-жертвой, и H69/V70, характерная для варианта коронавируса норок.
Повсеместно распространившаяся D614G остается единственной мутацией коронавируса, которую часть ученых связывают с повышенной заразностью (другие указывают, что вывод не столь однозначен). Предположительно такой вирус быстрее размножается в дыхательных путях, поэтому концентрация вирусных частиц в выдыхаемом воздухе больше, как и вероятность заразиться при контакте. Но летальность этого варианта не выше других. От варианта с H69/V70, по всей видимости, немного хуже защищают вакцины.
Замены в геноме не обязательно означают, что вирус стал опаснее или заразнее, это могут показать только лабораторные исследования, подчеркивает BBC. «Коронавирус эволюционировал в популяции животных и перешел к людям всего год назад. Он еще пробует разные комбинации мутаций, чтобы научиться их нормально заражать», — пишет агентство.
По скорости мутаций коронавирус находится примерно посередине между вирусами кори или коклюша, вакцины от которых работают уже полвека, и гриппа, вакцины от которых нужно обновлять каждый год. Ученые рассчитывают минимум на несколько лет эффективности создающихся сейчас коронавирусных вакцин.
Однако именно с началом массовых вакцинаций настанет очень опасный момент: вирус широко циркулирует в популяции, то есть количество мутаций высоко, а естественный отбор начинает работать на невосприимчивость к вакцине и на заражение уже вакцинированных людей.
«Как только началась вакцинация, таймер запущен: известно, что вирусы начинают эволюционировать ускоренными темпами, чтобы избежать уничтожения в частично вакцинированной популяции», — пишет NBC. «У вирусов невероятная приспособляемость, и вот именно тогда мы увидим значительные мутации», — предсказывает Джефф Бакстер, руководитель VBI Vaccines, работающей над универсальной коронавирусной вакциной.
Но и здесь хороших новостей больше, чем плохих:
«Заразная» мутация коронавируса имеет тенденцию делать его уязвимее для вакцин, как произошло с D614G.
Коронавирус сравнительно сложно устроен, его геном меняется сравнительно медленно (в отличие от гриппа, у него есть «автокоррекция» ошибок).
Мутация, полностью «отключающая» вакцину, почти невероятна.
Антитела, приобретенные после болезни или прививки, способны реагировать даже на сильно изменившийся вирус, пусть менее эффективно.
Создаются альтернативные вакцины, нацеленные не на больше всего подверженный мутациям шиповидный белок, а на другие части вируса.
Все это не исключает «кошмарного сценария» — того, что в результате какой-то мутации — или их сочетания — коронавирус научится ускользать от вакцин. Стоит еще раз подчеркнуть, что вероятность этого очень мала. Но в таком случае возможно, что коронавирусные вакцины придется регулярно обновлять, при этом внимательно отслеживая все возникающие штаммы.
Вероятность такого сценария увеличивает неконтролируемая циркуляция и накопление мутаций «человеческим» коронавирусом в популяциях животных, например норок, пишут ученые. С этой точки зрения уничтожение популяции норок в Дании и Нидерландах следует признать оправданным.