В 2008 году во время раскопок в Денисовой пещеры на Алтае археологи нашли крошечный обломок кости фаланги детского мизинца. Образец отдали на секвенирование ДНК в палеогенетическую лабораторию немецкого Института эволюционной антропологии Макса Планка. Через два года палеогенетики выяснили, что мизинец принадлежал девочке — представительнице нового, ранее неизвестного науке вида древнего человека, по происхождению намного более древнего, чем Homo sapiens (непосредственные предки современных людей) и неандертальцы. Эти виды Homo существовали параллельно; это означало, что линейной эволюции древнего человека не было. Новый вид древнего человека назвали в честь пещеры денисовцем.


Впоследствии в той же пещере были найдены еще несколько костных останков денисовцев, неандертальцев и один гибрид денисовца и неандерталки. Костных останков Homo sapiens в древних слоях в пещере не обнаружили.
Еще несколько лет назад ДНК умели извлекать только из антропологических материалов: зубов, костей, ногтей, волос и кожи. Причем, для такого анализа нужна была хорошая сохранность и достаточные количества материалов — найденный 13 лет назад кусочек фаланги девочки весь «ушел» на анализы. Сейчас же в Институте эволюционной антропологии Макса Планка поставлен на поток метод извлечения следов митохондриальной (мт) ДНК из грунта. Следы ДНК в грунте могут сохраниться в мельчайших частицах костей или в испражнениях обитателей пещеры. С появлением этой технологии у палеогенетиков и археологов в сотни раз увеличилось количество информации на материале из тех же раскопок.

Заведующий лабораторией молекулярной палеогенетики и палеогеномики ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН»
Объем образцов митохондриальной ДНК из Денисовой пещеры вырос более чем на порядок. Эта работа позволяет проследить изменение генетического состава населения пещеры. Отбор проб охватывает все основные стратиграфические слои и соответствующие хронологические периоды. Благодаря такому подходу удалось проследить изменения в составе митохондриальной ДНК денисовцев и неандертальцев, что раньше было почти невозможно из-за острого дефицита пригодных для анализа образцов.
Из состояния, когда генетической информации для исследований было слишком мало, ученые внезапно оказались в ситуации, когда ее стало сразу очень много и в ближайшее время станет еще больше. Вместо обрывочной летописи, составленной по ДНК из единичных останков костей, ученые буквально за пару лет получили целую библиотеку данных о том, какие виды гоминидов и в какие периоды обитали в ее окрестностях.
Всего в публикации в журнале Nature исследователи сообщили о получении 175 образцов митохондриальной ДНК древнего человека почти во всех слоях и во всех трех галереях пещеры. Главное открытие — в пещере обитали не только денисовцы и неандертальцы, но и люди современного типа.
Анализ образцов помог ученым из Института археологии и этнографии СО РАН детализировать картину проживания разных видов древних людей в разные периоды.
Из 12 костных останков древних людей, найденных в Денисовой пещере за все годы раскопок, данные по 4 еще не опубликованы, 3 фрагмента принадлежали неандертальцам, 4 — денисовцам и 1 — их общему потомку, девочке-гибриду. Подобные гибриды, но уже неандертальцев и Homo sapiens ученым еще предстоит обнаружить, ведь в геноме современном человека европейского типа от 1,5 до 3% неандертальских генов.
В слоях возрастом 170 тысяч лет назад обнаружилась ДНК более архаичных неандертальцев, похожих на тех, что проживали на территории Испании около 450 тысяч лет назад. А в слоях от 120 до 90 тысяч лет назад — еще один генетически отличный вид неандертальцев. Таким образом, ученые нашли свидетельства трех волн миграции неандертальцев из Европы в Сибирь.
Исследование развеяло сомнения в том, что в Денисовой пещере в древности обитали люди современного физического облика. Этот факт заставил заново рассмотреть вопрос об авторстве украшений и орудий труда из камня и кости, обнаруженных в пещере ранее в слоях начала верхнего палеолита (промежуток от 55 до 45 тысяч лет назад): костяных иглах, подвесках из зубов хищников, кольце из мрамора, браслета из хлоритолита, ободка из бивня мамонта, бусин из скорлупы яиц страуса и других предметов искусства. Для их производства использовались довольно сложные технологические приемы — сверление, расточка, полировка, шлифовка, выгибание, что ставит вопрос об уровне развития древнего человека, который их сделал.

Ученые ИАЭТ СО РАН изначально предполагали, что найденные ими предметы искусства сделаны денисовцами, поскольку костей Homo sapiens в пещере не было обнаружено, а два костных фрагмента денисовцев как раз располагались в слоях, где были найдены многочисленные украшения. Однако тот же период — начало верхнего палеолита — обычно связывают с появлением в Евразии Homo sapiens, который достоверно производил такие предметы. После находки в Денисовой пещере ДНК Homo sapiens было бы логично предположить, что и украшения из пещеры сделали древние люди современного облика. Ученые, которые были изначально уверены в том, что предметы сделали именно сапиенсы, посчитали вопрос закрытым (об этом говорится и в статье в Nature).
Но сибирские археологи не отказываются от своей теории о «денисовском» авторстве сложных орудий и предметов искусства.

Заведующий отделом археологии каменного века ИАЭТ СО РАН
Мы получили данные о том, что на определенном этапе в окрестностях пещеры одновременно обитали все три подвида древнего человека, но у нас нет доказательств, что найденные предметы искусства сделали именно представители Homo sapiens. Напротив, у нас есть основания считать традиции производства предметов искусства и быта автохтонными, то есть сформировавшимися на местной основе, поскольку в нижней части 11-го слоя мы находили подвески из камня и швейные иглы, изготовленные с применением тех же приемов, которые использовались для создания предметов из верхней части того же слоя.
Нет сомнений, что представители Homo sapiens внесли свой культурный вклад и повлияли на жизнь более архаичных людей, живших на этих территориях. Но ни костных останков, ни ДНК человека современного физического облика в нижней части рядом с предметами искусства не было обнаружено, тогда как денисовская ДНК присутствует в большом количестве во всех слоях и галереях Денисовой пещеры. Костные останки денисовцев были в слоях рядом с предметами искусства. Возможно, здесь присутствовала небольшая популяция Homo sapiens, поэтому [от них] не осталось костных останков.
Разница в возрасте между слоями, где есть ДНК человека современного облика, и теми, где их нет, но есть предметы искусства и ДНК денисовцев, оценивается в 5-10 тысяч лет (55-45 тысяч лет назад). Можно ли объяснить эту разницу погрешностью датировки — это вопрос интерпретаций, говорят сибирские ученые.
Горный Алтай, возможно, был зоной контакта как разных гомининов, так и различных линий гиен и другой фауны. Кроме 178 образцов человеческой ДНК ученые получили 685 ДНК животных, обитавших в окрестностях пещеры в разные периоды от плейстоцена до голоцена. Смена видов животных в районе пещеры неизменно сопровождались и переменами в популяциях древних людей.
Палеонтологи считают, что расселение денисовцев следовало за миграцией фауны: плейстоценовые млекопитающие мигрировали из юго-восточной Азии вдоль восточных предгорий Гималаев (в 2019 году в горах Тибета был найден фрагмент челюсти денисовца), на северо-запад Алтая.
Мария Роговая
Фотографии Михаила Шунькова и Александра Пилипенко: Мария Роговая