6 декабря 2008 года в Москве на улице Липецкая было совершено нападение на русского мужчину, которого нападавшие из-за большой бороды приняли за священника. Из сообщений СМИ неясно, остался ли пострадавший жив. Об этом стало известно из новости о задержании группы, подозреваемой в попытке теракта в ресторане McDonald's в январе 2009 г. По данным следствия, задержанные причисляют себя к неоязыческому течению родноверов.

26 декабря 2008 года СУ СК при прокуратуре РФ по Татарстану возбудило уголовное дело по ч.1 ст. 282 (возбуждение национальной вражды или с использованием СМИ) по факту одной из публикаций организации Милли Меджлис (национальный парламент) татарского народа. 2 января 2009 года было возбуждено еще одно дело по той же статье, а затем дела были объединены в одно производство.

21 января 2009 года стало известно, что в Омске возбуждено уголовное дело по ч. 1 ст. 282 УК РФ (возбуждение ненависти либо вражды) за распространение DVD-дисков с экстремистским фильмом. В почтовых ящиках нескольких домов города были обнаружены диски с фильмом, включенным в Федеральный список экстремистских материалов . Название фильма не сообщается. На сегодняшний день в списке только два фильма, признанных экстремистскими - это кинофильм "Вечный жид" и фильм "Россия с ножом в спине.

20 января 2009 года Дзержинский районный суд Петербурга признал незаконным обыск , проведенный в декабре 2008 года следователями СКП в Научно-исследовательском центре "Мемориал". Суд также постановил вернуть все изъятые при обыске материалы, но отказался дать правовую оценку действиям Следственного комитета. Адвокат Иван Павлов не исключает возможности подачи иска в суд общей юрисдикции по поводу защиты чести, достоинства и деловой репутации "Мемориала".

В Москве задержана группа подозреваемых в совершении ряда терактов. Трое задержанных - 17-летние житель Москвы. Еще трое - уроженцы Волгограда: начальник отдела стратегического анализа и выработки госполитики Министерства спорта, туризма и молодежной политики РФ Петр Башелутсков, его двоюродный брат Давид Башелутсков и неработающий Станислав Лухмынин. Решается вопрос о задержании москвички Евгении Жихаревой. Следствие считает ее лидером задержанных.

С начала 2009 года в Свердловской области милиция задержала за раздачу религиозной литературы 14 членов организации "Свидетели Иеговы". Задержания были произведены в Асбесте, Бисерти, Невьянске и Пышме. Задержанных обыскали, сфотографировали и сняли с них отпечатки пальцев.

17 января состоялся очередной пикет в защиту историко-архитектурного музея-заповедника "Рязанский кремль". Организаторы планировали провести акцию в центре Рязани, на площади Победы, однако городская администрация предложила перенести пикет на аллею сквера перед кремлем, т.к. на площади в этот день была запланирована санитарная уборка. В акции приняли участие около 70 человек.

21 января 2009 года в Москве были арестованы три наци-скинхеда, подозреваемых в многочисленных нападениях на людей неславянской внешности. Задержаны проживающие в Москве 22-летний Антон Васильев и 18-летние Константин Кучер и Андрей Гордеев. По данным предварительного следствия, задержанные причастны примерно к 20 расистским нападениям, жертвами которых оказались итайцы, африканцы, корейцы и один гражданин России из Бурятии . У молодых людей изъяли кинжал и баллончик со слезоточивым газом.

Утром 15 января неизвестные разбили пять окон репетиционного зала дома молитвы евангельских христиан-баптистов в Зеленограде. В разбитые окна были брошены бутылки и комья мерзлой земли. Вызванный наряд милиции зафиксировал происшествие. Новые стекла прихожане вставили собственными силами. Источники Вандализм в Зеленограде // Сайт РСЕХБ. 2009. 18 января.

21 января 2009 года появилось сообщение о том, что Московское бюро по правам человека обнаружило антисемитизм в брошюре, изданной Всероссийским институтом повышения квалификации сотрудников МВД России. Речь идет о брошюре Евгении Герасименко под названием "Экстремизм: понятие, социально-экономические, политические и исторические причины явления, тенденции его развития. Лекция", распространявшейся осенью 2008 года на совместной конференции Департамента по противодействию экстремизму (МВД) и МБПЧ.

20 января 2009 года в Ленинском районном суде Ставрополя началось рассмотрение дела группировки наци-скинхедов, обвиняемых в серии расистских нападений. Почти всем из 10 человек, большинство из которых являются студентами городских вузов и колледжей, инкриминируется ст. 282 УК РФ (возбуждение ненависти либо вражды). Следствие установило, что в 2007 г. подозреваемые объединились в группу "Белый легион" и регулярно проводили в городе неонацистские рейды.

15 января был открыт доступ в Серафимовский придел Троицкого кафедрального собора Пскова, иконостас которого, спроектированный и написанный известным иконописцем архимандритом Зиноном (Теодором), находился на реставрации. Искусствоведы и общественность выражали беспокойство в связи с тем, что реставрация проводится с многочисленными нарушениями, а уникальные иконы переписываются масляными красками. Епархия опровергала эту информацию.

Группе православных активистов, обратившихся в префектуру Центрального административного округа Москвы с заявкой на проведение пикета против возможной автокефалии Украинской Православной Церкви Московского патриархата, не дали разрешения на проведение акции. Отказ был мотивирован тем, что заявка неправильно оформлена. В неофициальной беседе сотрудники префектуры сослались на полученное ими письмо из Московской патриархии.